Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tra2bP62996 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms