Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms