Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2fP61219 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2fP61219 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2fP61219 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms