Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ppfia3P60469 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms