Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcbp1P60335 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms