Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actn4P57780 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms