Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp25P57080 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp25P57080 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp25P57080 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp25P57080 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp25P57080 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp25P57080 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp25P57080 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp25P57080 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp25P57080 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms