Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf5P56477 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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