Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp5P56399 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms