Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nub1P54729 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nub1P54729 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nub1P54729 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nub1P54729 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nub1P54729 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nub1P54729 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nub1P54729 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nub1P54729 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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