Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms