Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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