Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms