Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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