Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa11P50709 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa11P50709 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms