Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TspoP50637 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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TspoP50637 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TspoP50637 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms