Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtshP49935 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtshP49935 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtshP49935 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms