Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp3P49194 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms