Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms