Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms