Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca1P48754 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca1P48754 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca1P48754 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca1P48754 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca1P48754 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca1P48754 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca1P48754 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca1P48754 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brca1P48754 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms