Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrprbP47758 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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SrprbP47758 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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SrprbP47758 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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SrprbP47758 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrprbP47758 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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