Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pbx1P41778 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pbx1P41778 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pbx1P41778 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pbx1P41778 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pbx1P41778 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pbx1P41778 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx1P41778 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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