Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mmp9P41245 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mmp9P41245 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mmp9P41245 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mmp9P41245 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mmp9P41245 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mmp9P41245 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mmp9P41245 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms