Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VhlP40338 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VhlP40338 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms