Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtlP38585 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtlP38585 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms