Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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