Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddit3P35639 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms