Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab18P35293 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab18P35293 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms