Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms