Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Hoxc11P31313 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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