Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms