Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnd3P30282 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms