Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col2a1P28481 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms