Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aco1P28271 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms