Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2afxP27661 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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