Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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