Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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Xrcc5P27641 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Xrcc5P27641 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Xrcc5P27641 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Xrcc5P27641 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Xrcc5P27641 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xrcc5P27641 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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