Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PparaP23204 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PparaP23204 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PparaP23204 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PparaP23204 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PparaP23204 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms