Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NefhP19246 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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NefhP19246 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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NefhP19246 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NefhP19246 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NefhP19246 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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