Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18527 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18527 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18527 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18527 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18527 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18527 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18527 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18527 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18527 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18527 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18527 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18527 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18527 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18527 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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