Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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