Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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