Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spi1P17433 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Spi1P17433 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Spi1P17433 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Spi1P17433 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spi1P17433 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms