Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms