Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb1P12658 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb1P12658 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms