Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp1P11103 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms