Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P10404 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P10404 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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