Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprqP0C5E4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms