Protein–RNA interactions for Protein: P0C0A3

Chmp6, Charged multivesicular body protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp6P0C0A3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp6P0C0A3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms